BAZA NAUKOWO-DYDAKTYCZNA

WYDZIAŁU BIOLOGII I BIOTECHNOLOGII

Pracownie dydaktyczno-naukowe Wydziału Biologii i Biotechnologii mieszczą się w 5 obiektach na terenie miasteczka akademickiego w Kortowie.

Przełomowym wydarzeniem dla funkcjonowania Wydziału było oddanie do użytku i pełne zagospodarowanie nowego obiektu Collegium Biologiae o łącznej powierzchni użytkowej 6088m2, z główną aulą wykładową (280 miejsc) oraz mniejszymi salami wykładowymi (25-80 miejsc).

W Collegium Biologiae znajduje się także pracownia komputerowa oraz pracownie naukowo-dydaktyczne, w których prowadzone są zajęcia ze studentami. Wszystkie sale wyposażone są w rzutniki multimedialne oraz zestawy komputerowe z dostępem do Internetu. Bogate zaplecze dydaktyczne Wydziału Biologii i Biotechnologii jest wykorzystywane także przez inne Jednostki Uniwersytetu, np.: Wydział Lekarski, Szkoła Zdrowia Publicznego, Wydział Kształtowania Środowiska i Rolnictwa, Wydziału Bioinżynierii, Wydział Nauki o Żywności, Wydział Humanistyczny, Wydział Matematyki i Informatyki.

W 2010 roku do celów naukowych i dydaktycznych został uruchomiony Ośrodek Naukowo-Dydaktyczny „Laboratorium Diagnostyki Molekularnej” (LDM), w którym znajdują się specjalistyczne pracownie wyposażone w najnowocześniejszą aparaturę.

Budynek Collegium Biologiae oraz Ośrodek Naukowo-Dydaktyczny „Laboratorium Diagnostyki Molekularnej” są w pełni przystosowane dla studentów niepełnosprawnych (dostępne są podjazdy dla wózków, winda, przystosowane toalety).

Wysoka jakość badań prowadzonych przez pracowników Wydziału sprzyja unowocześnianiu i doskonaleniu procesu kształcenia i stałemu wzbogacaniu programów kształcenia. Na Wydziale Biologii i Biotechnologii jest stale wspierany i rozwijany profesjonalizm kadry naukowo-dydaktycznej, a prowadzone badania naukowe są ściśle powiązane z procesem dydaktycznym.

Na naszym Wydziale nowoczesna edukacja odnosi się bezpośrednio do współczesnej wiedzy biologicznej, dorobku naukowego kadry naukowo-dydaktycznej oraz profesjonalnie wyposażonych pracowni, w których realizowane są zajęcia ze studentami.

  Wyposażenie Katedr w wyspecjalizowaną aparaturę badawczą

Katedra Anatomii i Fizjologii Zwierząt

 Najważniejsza aparatura znajdująca się w Katedrze:

• Mikroskop fluorescencyjny BX51 (Olympus) z kamerą cyfrową i oprogramowaniem;
• Mikroskop fluorescencyjny AX10 (Zeiss) z kamerą cyfrową i oprogramowaniem;
• Zestaw do Real-Time PCR Aria MX (AGILENT TECH.) z oprogramowaniem;
• Ultrawirówka L7-65 (Beckman);
• Komora laminarna (ALPINE);
• Inkubaror CO₂  (BINDER);

• Termocykler gradientowy (SYNGEN SensQuest);
• Uniwersalny czytnik płytek (Tecan Infinite M200 Pro);
• Zestaw do archiwizacji żelowej (SYNGEN G:Box);
• Zestaw do archiwizacji żelowej (Azure 280 Biosystems);
• Aparaty do szybkiego transferu białek (INVITROGEN).

Katedra Biochemii

Wyposażenie pracowni badawczych (s. P16, 310, 311, 313, 314, 329):

• Chromatograf cieczowy - Prominence UFLC Shimadzu wyposażony w autosampler, degazer, 2 pompy i detektor diodowy UV-VIS (SPD-M20A) z termostatowanymi kolumnami  C18 Jupiter 90 (Phenomenex) i PFP (Kinetex);
• Chromatograf cieczowy – HPLC VP Shimadzu wyposażony w autosampler, 2 pompy i detektor diodowy UV-VIS (SPD-M10A) z kolumnami  C18 Jupiter 300 (Phenomenex) i C4 Jupiter (Phenomenex)
• Chromatograf cieczowy - HPLC VP Shimadzu wyposażony w pompę, detektor refraktometryczny (RID-10A) i termostatowaną kolumnę do analiz węglowodanów
• Spektrofotometr UV-VIS (Halo RB-10; Dynamica) z oprogramowaniem UV Detective V1.0
• Skaner optyczny do analizy i archiwizacji obrazów żeli elektroforetycznych (ImageScanner, GE Healthcare)
• Czytnik mikropłytek Asys UVM 340 (Biochrom)
• Inkubator mikropłytek z funkcją mieszania (ELMI Sky Line)
• Zestaw do Western-blott - aparat do elektroforezy na 4 mini-żele i aparat do elektrotransferu półsuchego (BioRad)
• Zestaw do ekstrakcji SPE (J.T.Baker)
• pH-metr Edge (Hanna Instruments)
• Waga analityczna (Sartorius)
• Wyparka próżniowa Laborota 4002 (Heidolph)
• Wirówki, w tym z wymiennym rotorem (Eppendorf 5804R; MiniSpin)
• Demineralizator wody, I klasa czystości (ultraczysta) – Hydrolab HLP 5 UV i Millipore Direct Q 3 UV
• System do Real-Time PCR QuantStudio 3 (Applied Biosytems)
• Dwa termocyklery z gradientem temperatury (Eppendorf Mastercycler nexus)
• Komora Biosan UVT-S-AR - komora PCR do czystej pracy z próbkami RNA/DNA, zapewnia ochronę przed kontaminacją
• Termoblok Biosan Bio TDB-100 – aluminiowy termoblok mieszczący trzy mikroprobówek
• Wysokoobrotowa wirówka Eppendorf Centrifuge 5804
• Precyzyjna waga anlityczna (Radwag)
• Spektrofotometr Thermo Scientific NanoDrop 1000
• Czytnik ELISA (Biogenet)
• Transiluminatot UView mini (Bio-Rad)
• Aparat do izoelektroogniskowania białek Ettan IPGPhor 3; GE Heathcare
• Aparat do elektroforezy pionowej białek Dalt Six, GE Healthcare
• Aparat do elektroforezy poziomej kwasów nukleinowych, Advance (2 sztuki)
• Homogenizator ręczny - przystosowany do szybkiej homogenizacji małych ilości próbek
• Wirówka laboratoryjna Gilson - niewielkich rozmiarów wirówka laboratoryjna o stałej prędkości wirowania
• Dwie precyzyjne wagi anlityczne (Radwag)
• Mieszadło magnetyczne
• pH-metr (Hanna Instruments)
• Kołyska laboratoryjna
• Autoklaw parowy (Prestige Medical)
• Zamrażarka niskotemperaturowa SANYO do przechowywania próbek
• Cieplarki SANYO
• Systemy do elektroforezy pionowej BIORAD
• Komora laminarna wyposażona w lampę UV (Holten)
• Komora laminarna wyposażona w lampę UV (ALPINA)
• Inkubator CO₂ do prowadzenia hodowli in vitro (Panasonic)
• Mikroskop optyczny (Olympus)
• Zautomatyzowany licznik komórek Scepter (MerckMillipore)
• Zestawy pipet i pipetorów automatycznych

Wyposażenie pracowni dydaktycznych (s. 324, 325, 327):

• Waga analityczna Radwag model as220.R2
• Waga Radwag WLC 0,6/B1
• Suszarka do szkła Alpina s-40
• Wortex Ohaus model VXMNAL
• Termoblok HG1DG
• Spektrofotometr Vis-5000
• Spektrofotometr MarcelMini
• Łaźnia wodna TW20
• Wyparka rotacyjna zestaw z pompą próżniową HB4 Basic
• Spektrofotometry Specol 11
• Pipety automatyczne
• Łaźnia wodna do wyparki LP-1812-378-375
• Łaźnie wodna WSL
• Łaźnia wodna z wytrząsarką SW
• Łaźnia wodna Re-86
• Vortex DragonLab
• Wirówka Cofiguge marki Eppendorf 5804R
• Ultrazamrażarki (Sanyo; Panasonic)
• Liofilizator Alpha1 – 4LD
• Wyparka rotacyjna r-3

Wyposażenie sali seminaryjnej (s.328): 

• rzutnik multimedialny
• laptop

Katedra Botaniki i Ochrony Przyrody

Wyposażenie Katedry obejmuje:

• Pracownia sekwencjonowania DNA i RNA

Sekwenatory nanoporowe MinION MK1C, i MK1B, termocyklery tradycyjne i Real-time PCR, system elektroforezy kapilarnej: Tape Station, Qiaxcell, fluorymetr Qubit, spektrofotometr, wirówki wysokoobrotowe.

• Pracownia roślinnych kultur in vitro

Dwie komory laminarne; cieplarki; pokój hodowlany, autoklaw parowy SMS; autoklaw mikrofalowy, system oczyszczania wody.

• Pracownia mikroskopii świetlnej

Badawcze mikroskopy stereoskopowe, mikroskop prosty badawczy, mikroskop optyczny z kontrastem fazowym, mikroskop optyczny z kontrastem, mikroskop stereoskopowy na statywie, kamera cyfrowa do mikroskopu, lampy do oświetlania światłowodami, sterowniki pamięci do systemu oświetlania, komputery, program do archiwizacji.

• Pracownia bioinformatyczna

Cztery stanowiska komputerowe.

• Sala dydaktyczna 102

Mikroskopy świetlne (25 szt.), mikroskopy stereoskopowe (12 szt.), mikroskop diagnostyczny, kamera cyfrowa do mikroskopu, oświetlacz do mikroskopu, rzutnik, ekran projekcyjny, projektor multimedialny, komputer, tablica.

• Sala dydaktyczna 120

Mikroskopy świetlne (24 szt.), ekran elektryczny, projektor multimedialny, rzutnik, mikroskop diagnostyczny, kamera cyfrowa do mikroskopu, oświetlacz do mikroskopu, komputer, tablica.

Katedra Ekologii i Ochrony Środowiska

Wyposażenie Katedry obejmuje:

• Pracownia badań molekularnych ptaków

Stanowisko do izolacji i oceny jakości DNA (komora laminarna Alpina K700, łaźnia wodna GRANT LSB AquaPro, termocykler SimpliAmp Applied Biosystems, wirówka Hettich U320, auktoklaw Cominox, cieplarka Memert, zestaw do elektroforezy SERVA, spektrofotometr FastGene), badań hematologicznych (aparaty HaemoCue, wirówka hematokrytowa Hettich 200)

• Pracownia mikroskopowa

Mikroskop stereoskopowy OLYMPUS SZ61 z kamerą, zintegrowany z komputerem i specjalistycznym oprogramowaniem obrazowania i analizy morfometrycznej Olympus cellSens Imaging Software

• Pracownia hydrobiologiczna

1) Spektrofotometr DR 5000 z oprogramowaniem Hach LANGE

2) Miernik jakości wody Hanna HI 9829-01042 (pH/ORP, EC, tlen, mętność) z inteligentną sondą, systemem GPS i funkcją wyszukiwania FastTrack.

3) Tlenomierz Hanna HI 98193 z sondą tlenową HI 764073, programem transferu danych kompatybilnym z Windows®.

Katedra Fizjologii, Genetyki i Biotechnologii Roślin

Wyposażenie Katedry obejmuje:

a) Baza dydaktyczna (sale do ćwiczeń):

Oddzielne sale do ćwiczeń laboratoryjnych z: fizjologii roślin, biologii komórki, badań molekularnych, badań in vitro, genetyki, pracownia komputerowa oraz sala seminaryjna. Specjalistyczne pracownie: chromatograficzna, mikroskopowa, biologii nasion, analizy białek, badań molekularnych.

b) Baza naukowa (wybrana aparatura):

• chromatografy gazowe
• chromatograf gazowy z kwadrupolowym spektrometrem mas
• zestaw do chromatografii HPLC
• mikroskop konfokalny
• mikroskopy fluorescencyjne
• mikroskopy stereoskopowe
• mikroskop elektronowy skaningowy
• ultramikrotom
• ÄKTA zestaw do separacji i oczyszczania białek
• analizator aminokwasów
• zestawy do elektroforezy 1 i 2-D
• aparat do elektroforezy kapilarnej
• oprogramowanie do testu kometowego
• czytnik mikropłytek
• termocyklery
• systemy dokumentacji żeli
• Geneious – oprogramowanie do sekwencjonowania NGS
• spektrofotometry UV-VIS
• komory klimatyczne/inkubatory
• ultrazamrażarki
• liofilizator półkowy
• młyny wibracyjne
• wirówki z chłodzeniem
• wyparki próżniowe
• systemy oczyszczania wody

Katedra Mikrobiologii i Mykologii

Najważniejsza aparatura znajdująca się w Katedrze:

Pracownia mikrobiologiczna ogólna

• kompletne wyposażenie umożliwiające prowadzenie klasycznych badań mikrobiologicznych i mykologicznych;
• urządzenia sterylizujące (autoklawy, sterylizatory suche),
• inkubatory, w tym komora anaerobowa,
• lodówki, zamrażarki, w tym zamrażarka -80°C

Pracownia mikroskopowa

• urządzenie do fluorescencji i kontrastu Nomarskiego z możliwością cyfrowej rejestracji obrazu – zestaw na bazie mikroskopu Olympus BX 51.

Pracownia mikrobiologii molekularnej

• wyposażenie klasyczne: termocyklery, aparaty do elekroforezy, czytniki UV, spektrofotometr UV-VIS, homogenizatory: mechaniczny i ultradźwiękowy

Pracownia badań biotechnologicznych

• zestaw bioreaktorów do prowadzenia hodowli mikroorganizmów z systemem sterowania, kontroli i dozowania mediów - nowoczesne bioreaktory umożliwiające kontrolę procesów biotechnologicznych w kierunku produkcji  cennych użytkowo bioproduktów przez mikroorganizmy; możliwość kontroli kaskadowej stężenia rozpuszczonego tlenu za pośrednictwem zmian prędkości mieszania, przepływu gazów, stężenia gazów w tym tlenu (%).

Katedra Zoologii

Wyposażenie Katedry obejmuje:

1. Pracownia mikroskopii świetlnej

• Mikroskop Nikon Eclipse 80i  kontrastem Nomarski-DIC z kamerą i oprogramowaniem NIS Elements
• Mikroskop stereoskopowy Olympus SZX 10 z kamerą i oprogramowaniem

2. Pracownia mikroskopii fluorescencyjnej

• Mikroskop fluorescencyjny Nikon Eclipse 90i z kamerami kolorową i monochromatyczną chłodzoną oraz oprogramowaniem Lucia Cytogenetics i NIS Elements (2 stanowiska)
• Mikroskop Olympus BX51 z kamerą monochromatyczną i oprogramowaniem Multiscan.
• Cytometr przepływowy CyFlow Ploidy Analyser Sysmex

3. Pracownia systematyki molekularnej

• Komora laminarna ESCO AIRStream
• Termocykler Applied Biosystem GeneAmp PCR System 2700
• Spektrofotometr Eppendorf Biophotometer 6131
• System do wizualizacji żeli UVTEC
• Dejonizator wody Hydrolab
• Zestaw do elektroforezy poziomej Biorad

4. Laboratorium histologiczne

• Mikrotom rotacyjny Leica RM 2265
• mikroskop świetlny Leica DM 500
• mikroskop stereoskopowy Nikon SMZ 800

5. Pracownia cytogenetyczna

• Inkubator POL-EKO
• Komora laminarna Polon
• Wirówka z chłodzeniem MPW - 351R

• Wirówka MPW 340

6. Pracownia parazytologiczna

• inkubator z CO₂
• mikroskop stereoskopowy Nikon SMZ 745T

7. Sala akwariowa

• Zestaw akwariów ze stałym przepływem wody, napowietrzaniem i regulacją temperatury do hodowli ryb.

Ośrodek Naukowo-Dydaktyczny „Laboratorium Diagnostyki Molekularnej”

W budynku LDM można korzystać z następujących pracowni: 

a) Pracownia analizy kwasów nukleinowych

 · Termocyklery do analizy Real-Time PCR – pozwalają na przeprowadzanie reakcji PCR z analizą przyrostu ilości produktu w czasie rzeczywistym, która stosowana jest do pomiaru ilościowego kopii genu, transgenu czy genomów wirusowych i bakteryjnych lub poziomu ekspresji RNA w komórkach i tkankach.

 · Termocyklery do reakcji na szklanych płytkach – umożliwiają wykonywanie reakcji PCR z niewielkiej ilości materiału genetycznego; całkowita objętość reakcji to zaledwie 1 mikrolitr.

 · Termocyklery z gradientem – służą do przeprowadzania standardowych reakcji PCR oraz reakcji w gradiencie temperatur.

 · Sekwenator (obecnie niesprawny) – służy do określania sekwencji nukleotydów wybranych odcinków DNA o długości do 1000 pz, genotypowania za pomocą markerów mikrosatelitarnych oraz analiz AFLP i innych.

 · Bioanalizator – wykorzystuje technikę mikroprzepływów do analizy ilościowej oraz jakościowej DNA, RNA i białek, jest alternatywą dla elektroforezy żelowej. Dziedziną, w której bioanalizator znajduje szczególne zastosowanie jest analiza jakości oraz czystości DNA i RNA, niezbędna przy badaniu ekspresji genów za pomocą mikromacierzy.

 · Skaner do analizy mikromacierzy – posiada system otwartego skanowania umożliwiający analizę szerokiego wachlarza dostępnych na rynku mikromacierzy. Bardzo wysoka rozdzielczość (2 mikrometry) pozwala na skanowanie macierzy o gęstości do 1 miliona prób.

 · Systemy do elektroforezy agarozowej, archiwizacji żeli i membran – zestaw różnej wielkości aparatów do elektroforezy agarozowej pozwala na rozdziały kwasów nukleinowych. System do archiwizacji żeli i membran wyposażony w kamerę CCD oraz specjalistyczne oprogramowanie służy do jakościowej analizy żeli i analizy ilościowej metodą densytometryczną.

 · Wielodetekcyjne czytniki mikropłytek (SpectraMax iD5, Infinite M200) – z funkcją absorbancji, fluorescencji i luminescencji. Umożliwiają odczyt w standardowych płytkach titracyjnych (6-384 dołków). Urządzenie Infinite M200 umożliwia również odczyt w kuwetach oraz na płytce kwarcowej NanoQuant (16 jednoczesnych pomiarów stężenia DNA, RNA z małych objętości prób), a także jest zintegrowane z urządzeniami peryferyjnymi: inkubator (5-42°C), wytrząsarka, dwa dyspensery oraz płuczka pozwalając na przeprowadzanie złożonych analiz obejmujących np. badania kinetyczne.

 · Stacja pipetująca – to kompaktowe i zautomatyzowane urządzenie, eliminujące błędy ludzkie, służące do precyzyjnego i powtarzalnego przenoszenia cieczy w laboratorium.

 · Spektrofotometry do mikroobjętości – umożliwiają szybką analizę ilościową i jakościową (np. stężenia DNA, RNA i białek) przy użyciu zaledwie 1 mikrolitra próbki, eliminując konieczność stosowania tradycyjnych kuwet na większe objętości. Umożliwiają pomiar bezpośrednio w kropli.

b) Pracownia cytometrii przepływowej

Wyposażona w dwa cytometry przepływowe, które służą do pomiaru właściwości fizycznych i fluorescencji komórek/cząstek przepływających w strumieniu cieczy. W cytometrze można m.in. oceniać ekspresję antygenów powierzchniowych i wewnątrzkomórkowych (receptory, cytokiny, hormony), badać aktywność wielu enzymów (kinazy, kaspazy), proces apoptozy oraz cykl komórkowy. Jedno z urządzeń umożliwia także sortowanie komórek z jednoczesną analizą cytometryczną. Funkcja sortowania komórek, poza gromadzeniem danych o przepływających komórkach (wielkość, obecność ziarnistości, sygnały fluorescencyjne), ma możliwość ich rozdzielania w wysokim stopniu czystości (>99%).

c) Pracownia analizy białek 

· Elektroforeza 2D – systemy do dwukierunkowego rozdziału białek w żelach poliakrylamidowych obejmują aparaty do izoelektroogniskowania białek oraz aparaty pozwalające na rozdzielenie białek pod względem mas cząsteczkowych. Pozwala to na porównanie profili białkowych komórek i tkanek, mogących wykazywać różnice w zależności od stadium rozwojowego lub w wyniku działania procesów technologicznych, czynników zewnętrznych, stanów chorobowych itp.

 · Dokumentacja – skaner optyczny umożliwia dokumentację żeli i membran barwionych metodami tradycyjnymi (Coomassie R-250, G-250, Silver Staining, Deep Purple, Sypro Ruby itp.), natomiast urządzenie Ettan DIGE Imager pozwala na wizualizację i dokumentację żeli znakowanych pojedynczymi fluorochromami lub wykonanych w technice DIGE. Do urządzeń dołączone jest specjalistyczne oprogramowanie pozwalające na jakościową i wstępną ilościową analizę rozdzielonych białek.

 · Frakcjonator – urządzenie do frakcjonowania w gradientach stężeń pozwala na rozdzielenie różniących się wielkością makromolekuł, struktur komórkowych lub ich poszczególnych frakcji. Znajduje zastosowanie w analizie frakcji subkomórkowych, badaniach ekspresji białek itp.

 · Zautomatyzowany system do proteomiki w żelach (Digester, Spot picker, Spotter) – automatyczna linia umożliwiająca wyizolowanie określonych białek z żelu, poddanie ich trawieniu enzymatycznemu oraz przygotowanie i naniesienie uzyskanej mieszaniny peptydów na płytki matrycowe. Linia ta jest zintegrowana z instrumentem do spektrometrii mas typu MALDI – TOF/TOF.

 · Aparaty do transferu półsuchego – to urządzenia stosowane w technice m.in. Western Blot do przenoszenia (elektrotransferu) rozdzielonych w żelu białek na trwałą membranę (np. PVDF lub nitrocelulozową).

 · Spektrofotometry do mikroobjętości – umożliwiają szybką analizę ilościową i jakościową (np. stężenia DNA, RNA i białek) przy użyciu zaledwie 1 mikrolitra próbki, eliminując konieczność stosowania tradycyjnych kuwet. Umożliwiają pomiar bezpośrednio w kropli. 

d) Pracownie mikroskopowe (mikroskopii fluorescencyjnej, mikroskopii elektronowej) 

· Transmisyjny mikroskop elektronowy (Jeol JEM 1400) – o zdolności rozdzielczej 0,2 nm. Umożliwia uzyskiwanie powiększeń z zakresu od x200 do x1 200 000. Na wyposażeniu pracowni jest także przystawka skaningowa oraz system mikroanalizy roentgenowskiej EDS.

 · Mikroskopy fluorescencyjne – posiadają pełen zestaw filtrów do fluorescencji oraz specjalne obiektywy z zupełnie nowej serii VC (Violet Correction), o znacznie wyższych parametrach optycznych w zakresie ultrafioletowym. Wyposażone w oprogramowanie do analiz cytogenetycznych. Fabrycznie przystosowane do dokumentacji cyfrowej.

 · Mikroskop stereoskopowy (binokular) – pozwala na przestrzenne widzenie powiększonego obrazu. Widziany w nim obraz jest trójwymiarowy, dzięki czemu nadaje się do obserwacji poruszających się małych obiektów np. owadów. Posiada szeroki stół roboczy z oświetleniem górnym, dolnym oraz bocznym (światłowodowym).

 · Mikroskop świetlny z kamerą – łączy tradycyjny układ soczewek z matrycą cyfrową, umożliwiając podgląd próbki na żywo, rejestrację zdjęć oraz nagrywanie filmów. Rozwiązanie to pozwala na jednoczesną pracę wielu osób nad jednym preparatem.

 · Mikrodysekcja laserowa – umożliwia wycinanie fragmentów z preparatów mrożonych, parafinowych, pojedynczych komórek, fragmentów komórek, chromosomów, rozmazów itp. System CellCut przeznaczony jest do precyzyjnej mikrodysekcji oraz mikromanipulacji za pomocą wiązki lasera. System oparty jest na unikalnej i opatentowanej technologii CapLift gwarantującej możliwość pobrania materiału bez kontaminacji. Dzięki temu może on być wykorzystywany w takich dziedzinach jak biologia molekularna, cytogenetyka, patologia, mikrobiologia oraz biologia rozrodu

 · Mikroskop cyfrowy piątej generacji Keyence 4K VHX-7000 – wyposażony w matrycę CMOS 4K, która zapewnia wysoką rozdzielczość przy niskim poziomie szumu. Unikalną funkcją tego systemu jest efekt cienia optycznego pozwalający uzyskać obrazy zapewniające głębię ostrości i ukazujące najdrobniejsze detale, takie jak niewielkie nierówności powierzchni lub drobne niedoskonałości. Badane obiekty mogą być obserwowane przy użyciu automatycznego zoomu bezstopniowego w zakresie powiększenia od 20x do 6000x bez potrzeby wymiany obiektywu. Stopień powiększenia można w praktyczny sposób zmieniać przy użyciu myszy lub konsoli. Mikroskop jest w pełni zmotoryzowany, wyrównanie próbki, regulacja ostrości, wybór powiększenia itd. są w pełni zautomatyzowane. Mechanizmy regulacyjne pozwalają na swobodne przemieszczanie obiektywu w osi XY i obserwację badanych obiektów pod różnymi kątami. Oprócz obserwacji 2D, mikroskop umożliwia obserwacje prób w systemie 3D. Nawet przy nierównej powierzchni próbki, dzięki użyciu funkcji "kompozycja głębi", możliwe jest uzyskanie w pełni wyostrzonego obrazu. Dodatkowo, mikroskop ten pozwala na uzyskiwanie bardzo dokładnych zdjęć dużych obiektów powstałych ze złożenia wielu szczegółowych obrazów. Obrazy te można również wizualizować używając funkcji 3D. Możliwy jest również pomiar nieregularności powierzchni.

 e) Pracownia zwierzęcych kultur in vitro

 · Komory laminarne – z pionowym przepływem powietrza, II klasy bezpieczeństwa mikrobiologicznego Biohazard, przeznaczone są do ochrony zarówno materiału badawczego, jak i operatora oraz środowiska.

 · Inkubatory – wyposażone w system kontroli CO2 (0,2-20%) oraz wbudowany system autosterylizacji w wysokiej temperaturze.

· Mikroskop odwrócony – mikroskop laboratoryjny, przeznaczony do obserwacji obiektów „od dołu”, wyposażony w układ optyczny taki sam jak w tradycyjnych mikroskopach. Umożliwia przyżyciową obserwację hodowanych komórek lub całych organizmów (np. pierwotniaków). Wyposażony w kamerę pozwalającą na archiwizację obserwowanych obrazów.

· Liofilizator – służy do suszenia wstępnie zamrożonych próbek poprzez sublimację, czyli usuwanie zamrożonej wody pod ciśnieniem (próżnia) z pominięciem stanu ciekłego. Proces ten zazwyczaj pozwala zachować pierwotną strukturę, skład chemiczny oraz aktywność biologiczną próbek.

 · Homogenizator ultradźwiękowy (sonikator) – to urządzenie wykorzystujące intensywne fale dźwiękowe m.in. do rozbijania cząstek, emulgowania, dyspersji oraz lizy komórek w cieczach. Dzięki zjawisku kawitacji redukuje małe cząstki, zapewniając ich równomierne rozłożenie i jednolitą strukturę próbki.

f) Pracownia hodowli zwierząt (obecnie nieczynna)

Wyposażona w komorę laminarną oraz pomieszczenia z możliwością regulacji temperatury, wilgotności i oświetlenia. Nowoczesne regały ze stali nierdzewnej oraz klatki z poliwęglanu odpornego na sterylizację służą do pracy z małymi zwierzętami laboratoryjnymi (myszy, szczury, króliki).

g) Pracownia roślinnych kultur in vitro

· Komora laminarna i regały do hodowli roślin w warunkach in vitro – komory laminarne umożliwiają bezpieczne założenie hodowli, natomiast wielokondygnacyjne regały wyposażone we własne wentylatory, lampy fluorescencyjne oraz tunele stabilizujące temperaturę pozwalają na prowadzenie długotrwałych hodowli.

 · Komory klimatyczne i inkubatory z chłodzeniem – inkubatory z chłodzeniem pozwalają na hodowlę niewielkich roślin w ustalonych warunkach temperatury, natomiast komory klimatyczne umożliwiają hodowlę roślin w ściśle ustalonych warunkach temperatury, wilgotności i natężenia światła. Oprogramowanie urządzeń pozwala na zaprogramowanie kilkunastu wieloetapowych programów, co ułatwia symulację zmiennych warunków zewnętrznych w czasie trwania hodowli. 

h) Pracownia hodowli roślin

Pokoje hodowlane pracowni wyposażone są w wielokondygnacyjne regały do hodowli roślin w warunkach in vitro. Regały te posiadają własne wentylatory, lampy fluorescencyjne oraz tunele

stabilizujące temperaturę, co umożliwia prowadzenie długotrwałych hodowli. Pracownia wyposażona jest także w inne urządzenia laboratoryjne, m.in. cieplarka, inkubator.

i) Pracownia mikrobiologiczna

Umożliwia różnokierunkowe badania materiału mikrobiologicznego, m.in. transformacje lub transfekcje bakterii wektorami plazmidowymi oraz analizę uzyskanych transformantów metodami biologii molekularnej. Kompleksowe wyposażenie pracowni (m.in. autoklaw, cieplarka, inkubator z chłodzeniem, spektrofotometr do analizy mikroobjętości, wirówka próżniowa z pułapka mrożeniową, komora laminarna) pozwala na wykonywanie wszystkich analiz bez konieczności opuszczania tej części laboratorium, co minimalizuje ryzyko przeniesienia materiału mikrobiologicznego do innych pomieszczeń. 

j) Pracownia izotopowa

Pomieszczenia umożliwiające pracę ze źródłami promieniotwórczymi (H3). Wyposażone w specjalistyczne dygestoria radiochemiczne, licznik scyntylacyjny, sprzęt dozymetryczny, pojemniki do przechowywania źródeł i odpadów promieniotwórczych oraz stałe i ruchome osłony przed promieniowaniem jonizującym.

k) Pracownia immunohistochemiczna 

Pracownia wyposażona w aparaturę umożliwiającą przygotowanie skrawków tkanek i narządów (mikrotom, kriostat), ich prezerwację (zatapiarka i łaźnia parafinowa, łaźnie wodne) oraz inkubacje z przeciwciałami (specjalistyczne cieplarki i chłodziarki) oraz barwienie w celu przygotowania do analiz immunohistochemicznych/cytochemicznych.

l) Pracownia spektrometrii mas

· Spektrometr masowy typu ESI-Q-TOF/TOF – sprzężony z chromatografem UHPLC, również będącym na wyposażeniu pracowni. System HPLC-MS dzięki wykorzystywanemu oprogramowaniu (Target Screener, MetaboScape, ProteinScape) umożliwia identyfikację, analizę i poszukiwania różnych związków mało- i wielkocząsteczkowych. Stwarza to możliwość kompleksowego badania materiału biologicznego różnego pochodzenia (ludzki, zwierzęcy, mikrobiologiczny, roślinny, środowiskowy, żywnościowy, farmakologiczny, kryminalistyczny itp.).

· Spektrometr masowy typu MALDI-TOF/TOF – umożliwia wykonanie analiz PMF (ang. peptide mass fingerprinting) i sekwencjonowania de novo oraz analiz modyfikacji potranslacyjnych i enzymatycznych białek czy struktury przeciwciał i ich modyfikacji. Spektrometr można także wykorzystać do badania substancji organicznych takich jak węglowodany, tłuszcze, fosfolipidy, alkaloidy, polimery, mykotoksyny itp. Urządzenie posiada także nowoczesną platformę do identyfikacji mikroorganizmów (MALDI Biotyper), która znacząco poszerza spektrum jego możliwości identyfikacyjnych i zwiększa kompleksowość oferowanych przez pracownię analiz. Dedykowana do tej platformy baza danych oferuje referencje do ponad 3000 szczepów bakteryjnych i grzybowych, stanowiąc potężne narzędzie w badaniach medycznych oraz bezpieczeństwa żywności.

m) Pracownie dydaktyczne

W LDM znajdują się dwie w pełni wyposażone pracownie dydaktyczne oraz połączone z nimi sale seminaryjne, w których można prowadzić liczne przedmioty kierunkowe oraz specjalnościowe.