Specjalizuje się w precyzyjnej analizie składu chemicznego i identyfikacji biomolekuł. W tym celu wykorzystywane są zaawansowane techniki spektrometrii mas do badań proteomicznych, metabolomicznych oraz diagnostycznych. Pracownia wyposażona jest w dwa urządzenia firmy Bruker Daltonics GmbH & Co. KG:

• spektrometr masowy typu LC-MS/MS (ESI-Q-TOF/TOF) – sprzężony z chromatografem UHPLC. System HPLC-MS dzięki wykorzystywanemu oprogramowaniu (Target Screener, MetaboScape, ProteinScape) umożliwia identyfikację, analizę i poszukiwania różnych związków mało- i wielkocząsteczkowych. Stwarza to możliwość kompleksowego badania materiału biologicznego różnego pochodzenia (ludzki, zwierzęcy, mikrobiologiczny, roślinny, środowiskowy, żywnościowy, farmakologiczny, kryminalistyczny itp.).
• spektrometr masowy typu MALDI-TOF/TOF – umożliwia wykonanie analiz PMF (ang. peptide mass fingerprinting) i sekwencjonowania de novo oraz analiz modyfikacji potranslacyjnych i enzymatycznych białek czy struktury przeciwciał i ich modyfikacji. Spektrometr można także wykorzystać do badania substancji organicznych takich jak węglowodany, tłuszcze, fosfolipidy, alkaloidy, polimery, mykotoksyny itp. Urządzenie posiada także nowoczesną platformę do identyfikacji mikroorganizmów (MALDI Biotyper), która znacząco poszerza spektrum jego możliwości identyfikacyjnych i zwiększa kompleksowość oferowanych przez pracownię analiz. Dedykowana do tej platformy baza danych oferuje referencje do ponad 3000 szczepów bakteryjnych i grzybowych, stanowiąc potężne narzędzie w badaniach medycznych oraz bezpieczeństwa żywności.