W pracowni możliwe jest prowadzenie zaawansowanych badań nad strukturą, funkcją i modyfikacjami białek. Dysponuje ona nowoczesną aparaturą umożliwiającą m.in. rozdział i identyfikację białek, analizę ich właściwości biochemicznych oraz badanie oddziaływań międzycząsteczkowych. Wyposażenie pracowni stanowi: 

• aparatura do izolacji i analizy białek, tj. elektroforeza dwukierunkowa (aparaty do izoelektroogniskowania, aparaty do rozdziału SDS-PAGE, skanery zwykły i fluorescencyjny);
• oprogramowanie do analizy ilościowej i jakościowej – ImageMaster 2D Platinum (GE Healthcare) i SameSpots (TotalLab);
• aparatura do przygotowania prób do spektrometrii mas – Spot Picker, Digester, Spotter (GE Healthcare);
• aparaty do transferu półsuchego do analiz Western Blot;
• frakcjonator (TELEDYNE ISCO);
• spektrofotometr do mikroobjętości – NanoVue (GE Healthcare).