Pracownia sekwencjonowania DNA i RNA

Pracę z sekwencjonowaniem kwasów nukleinowych rozpoczęliśmy, jak wiele innych zespołów badawczych, od sekwencjonowania DNA metodą Sangera. Obecnie w badaniach prowadzonych w naszej pracowni wykorzystujemy metodę sekwencjonowania wysokoprzepustowego III oraz IV generacji. Rozszerzyliśmy nasz warsztat również o badania RNA oraz metagenomikę. Przygotowujemy biblioteki genomowe do analizy na sekwenatorach Illumina MiSeq i HiSeq. Z powodzeniem zajmujemy się również sekwencjonowaniem nanoporowym z wykorzystaniem technologii MinION Oxford Nanopore. W codziennej pracy mierzymy się z wyzwaniami, jakie stawia przed nami konieczność izolacji DNA wysokocząsteczkowego o wysokiej czystości, a także pozyskiwania materiału genetycznego z trudnych do izolacji tkanek roślinnych obfitujących w metabolity wtórne.

Pracownia roślinnych kultur in vitro

Dwie komory laminarne; cieplarki; pokój hodowlany, autoklaw parowy SMS; autoklaw mikrofalowy, system oczyszczania wody.

Pracownia mikroskopii świetlnej

Badawcze mikroskopy stereoskopowe, mikroskop prosty badawczy, mikroskop optyczny z kontrastem fazowym, mikroskop optyczny z kontrastem, mikroskop stereoskopowy na statywie, kamera cyfrowa do mikroskopu, lampy do oświetlania światłowodami, sterowniki pamięci do systemu oświetlania, komputery, program do archiwizacji.

Pracownia bioinformatyczna

Cztery stanowiska komputerowe.